本タイトルでは、フィールドやダンジョンを自由に歩いて探索できます。
それらの場所では、敵の姿を見ることができ、敵に接触するとその場で戦闘となります。地形を考慮して敵に挑みましょう。

フィールドで攻撃ボタンを押すことで、“フィールドアタック”を発動できます。
敵の背後からフィールドアタックをヒットさせると、敵が“気絶”や“スタン”となったまま、有利な状況で戦闘を開始できます。

フィールド上には破壊可能なオブジェクトが点在しており、これらを“フィールドアタック”で破壊することで、様々な効果やアイテムを得られます。
また、障害物を破壊して、新たな道が開かれることもあります。

戦闘は、「軌跡」シリーズ独自の戦闘システムである“ＡＴバトル”です。
画面左のＡＴ(行動順)バーに応じて、キャラクターが順番に行動するコマンドバトルとなっています。

ＡＴバーには、“ＡＴボーナス”がつくことがあります。
ＡＴボーナスがついている時に行動したキャラクターは、さまざまな効果を受けて戦えるので、行動順を意識して有利に戦闘を進めましょう。

“ARCUSⅡ”は、『閃の軌跡』『閃の軌跡Ⅱ』に登場した“ARCUS(アークス)”の発展型となる最新の戦術オーブメントです。
“クオーツ”というアイテムをセットすることで、キャラクターの能力が向上したり、“アーツ（導力魔法）”が使用可能になったりします。

使用者のEP(エネルギー)を消費して発動する導力魔法です。 さまざまな効果のものがあり、使用するとATバーに行動が追加され、順番がくるとアーツが発動します。
発動に時間はかかりますが、強力な効果をもつため、使いこなしてみましょう。

戦闘中の敵には、その下に「ブレイクゲージ」という青いゲージが表示されます。
ブレイクゲージは、敵にダメージを与えたり、弱点属性で攻撃したりすると減らすことができ、０にすると敵が「ブレイク」状態になるため、有利に戦えます。

ブレイク状態に陥った敵は「被ダメージアップ」「能力上昇がすべて解除」「体勢崩し100％（行動不能）」となり、大幅に弱体化されます。
さらに、ブレイク発生時にはアイテムがドロップするため、積極的に狙ってみましょう。

“ARCUSⅡ”には、「戦術リンク」というシステムがあり、パートナーを選んでリンク設定ができます。
リンク設定しておくことで「体勢崩し」が発生した際、パートナーと一緒に攻撃をしかける「ラッシュ」や、戦闘メンバー全員で連携攻撃する「バースト」を使うことができます。

『閃の軌跡』『閃の軌跡Ⅱ』で登場した巨大人形兵器バトル「騎神戦」がパワーアップ！
リィンが操縦する灰色の騎神“ヴァリマール”の他、生徒たちも機甲兵に乗り、戦闘に参加します。

敵の騎神や機甲兵は、「ヘッド」「アーム」「ボディ」の３部位に分かれており、いずれか１つを選択して攻撃します。
弱点となる部位を狙って攻撃し、敵をブレイク状態にしましょう！